Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PERM1Q5SV97 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PERM1Q5SV97 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms