Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TTC39AQ5SRH9 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms