Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PITRM1Q5JRX3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms