Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C4orf17Q53FE4 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms