Protein–RNA interactions for Protein: Q53EZ4

CEP55, Centrosomal protein of 55 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP55Q53EZ4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CEP55Q53EZ4 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms