Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TPRNQ4KMQ1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TPRNQ4KMQ1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
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