Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
TTLL9Q3SXZ7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TTLL9Q3SXZ7 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms