Protein–RNA interactions for Protein: Q1XH10

SKIDA1, SKI/DACH domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 827 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIDA1Q1XH10 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SKIDA1Q1XH10 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SKIDA1Q1XH10 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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