Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
Q1T7F1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
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