Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CDKN3Q16667 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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