Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NTRK2Q16620 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms