Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ZNF239Q16600 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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