Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
DDB1Q16531 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DDB1Q16531 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
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