Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GRIK5Q16478 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GRIK5Q16478 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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