Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GABRA6Q16445 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms