Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
E2F4Q16254 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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