Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZIC1Q15915 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms