Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PUM3Q15397 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PUM3Q15397 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PUM3Q15397 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PUM3Q15397 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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PUM3Q15397 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PUM3Q15397 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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