Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HERC3Q15034 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HERC3Q15034 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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