Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NFIXQ14938 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NFIXQ14938 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
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