Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GINS1Q14691 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms