Protein–RNA interactions for Protein: Q14515

SPARCL1, SPARC-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPARCL1Q14515 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SPARCL1Q14515 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPARCL1Q14515 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPARCL1Q14515 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPARCL1Q14515 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPARCL1Q14515 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SPARCL1Q14515 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
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