Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSHL1Q14406 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms