Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CNGB1Q14028 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CNGB1Q14028 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
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