Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCINQ13939 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCINQ13939 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCINQ13939 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCINQ13939 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCINQ13939 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
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