Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GTF2H3Q13889 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms