Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DDX39BQ13838 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DDX39BQ13838 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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