Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TUBA3CQ13748 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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