Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
FHL3Q13643 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
FHL3Q13643 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms