Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX6Q13608 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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