Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PMS2P3Q13401 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms