Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP3B2Q13367 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
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