Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIGQ13278 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIGQ13278 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIGQ13278 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIGQ13278 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIGQ13278 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIGQ13278 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIGQ13278 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIGQ13278 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIGQ13278 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
RIGQ13278 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
RIGQ13278 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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