Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SRSF5Q13243 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SRSF5Q13243 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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