Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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NR1H3Q13133 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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NR1H3Q13133 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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NR1H3Q13133 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NR1H3Q13133 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
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