Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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FOXF2Q12947 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF2Q12947 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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