Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NIPAL4Q0D2K0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms