Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
IFFO1Q0D2I5 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
IFFO1Q0D2I5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms