Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CD300CQ08708 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms