Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDK18Q07002 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms