Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EGR3Q06889 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms