Protein–RNA interactions for Protein: Q06481

APLP2, Amyloid-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APLP2Q06481 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
APLP2Q06481 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
APLP2Q06481 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms