Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CENPCQ03188 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CENPCQ03188 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms