Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
IFITM3Q01628 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
IFITM3Q01628 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms