Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
DEFA6Q01524 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
DEFA6Q01524 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms