Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCN7AQ01118 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCN7AQ01118 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms