Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PITPNAQ00169 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PITPNAQ00169 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms