Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

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Length 4,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKD1P98161 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKD1P98161 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKD1P98161 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKD1P98161 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKD1P98161 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKD1P98161 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKD1P98161 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKD1P98161 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKD1P98161 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKD1P98161 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
PKD1P98161 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
PKD1P98161 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PKD1P98161 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PKD1P98161 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PKD1P98161 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PKD1P98161 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PKD1P98161 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PKD1P98161 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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PKD1P98161 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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PKD1P98161 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
PKD1P98161 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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