Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
VLDLRP98155 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
VLDLRP98155 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms