Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ACTA2P62736 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms